工资未超5000却被公司扣税，原因可能有多种。具体分析如下：1.若您的收入不止工资薪金，还包含劳务报酬、稿酬等其他类型，根据《中华人民共和国个人所得税法》，这些所得计税方式与工资薪金不同，综合计税可能导致税款产生。2.公司计算应纳税所得额时，若未准确扣除您的五险一金（专项扣除）或子女教育、赡养老人等专项附加扣除，可能使应纳税所得额超过5000元起征点，从而扣税。3.公司财务人员计算错误或系统故障，可能误将未达起征点的工资进行扣税。
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工资没超5000却被公司扣税，可能涉及特殊情况或例外情形，具体如下：1.年度综合所得超六万元的情况。虽然您每月工资未超5000元，但如果年度内其他月份工资较高，或有劳务报酬、稿酬等其他收入，导致全年综合所得超六万元，那么在年度汇算清缴时可能需缴税，公司平时代扣时可能已预留税款，影响对公司扣税行为合理性的判断。2.专项附加扣除未及时申报的情况。如果您有符合条件的专项附加扣除，但未及时向公司提交信息申报，公司在计算应纳税所得额时未扣除这部分金额，可能导致应纳税所得额超5000元而扣税。这种情况下，公司扣税基于当时申报信息，您补充申报后可申请退税，这一特殊情形会改变扣税结果及处理方式。
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针对工资没超5000公司扣税了的问题，结合法律依据分析公司扣税行为是否合法：根据《中华人民共和国个人所得税法》（2018修正）第六条规定：“居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。非居民个人的工资、薪金所得，以每月收入额减除费用五千元后的余额为应纳税所得额。”若您是居民个人且仅取得工资薪金所得，工资未超5000元时，扣除5000元后应纳税所得额为零，不应缴税；若您是非居民个人，同样以每月收入额减除5000元后的余额为应纳税所得额，未超过则不缴税。但如果存在收入类型包含其他所得、扣除项目未扣减完整等情况，公司扣税可能有相应依据，否则公司扣税行为不符合该法律规定。
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工资没超5000却被公司扣税，可能带来法律风险，具体如下：1.公司可能存在未依法履行代扣代缴义务或错误代扣的风险。如果公司在您工资未超5000元且无其他应纳税情形时擅自扣税，违反个人所得税法规定，您可能面临多缴税款的经济损失，还可能影响个人纳税记录。例如，公司财务人员因不熟悉税法，误将未达起征点的工资扣税，导致您实际收入减少。2.若因公司扣税错误导致您需要申请退税，可能存在退税流程繁琐、耗时较长的风险。在这种情况下，您需要向税务部门提交相关证明材料申请退税，若材料准备不齐全或流程不熟悉，可能导致退税不顺利，无法及时拿回多缴税款。您可以咨询我为您提供解答，帮您理清退税流程及所需材料。

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